Духовное управление мусульман Санкт-Петербурга и Северо-Западного региона России образовано в 1994 году в составе ЦДУМ (Центральное духовное управление мусульман России) на основе Мухтасибатского правления Северо-Западного региона РФ.
Духовное управление мусульман контролирует Соборную мечеть Санкт-Петербурга; расположено в здании рядом с нею.
Председателем и муфтием Духовного управления мусульман Санкт-Петербурга и Северо-Западного региона с момента его образования является Жафяр Насибуллович Пончаев, первым заместителем — Равиль Джафярович Панчеев.
