Родился в городе Тула в 1965 году.
В 80-е годы отслужил срочную службу в рядах Советской армии.
В 1991 г. с отличием окончил Московский автомобильно-дорожный институт по специальности "автомобили и автомобильное хозяйство".
В 1996 г. с отличием окончил Тульский государственный университет по специальности "финансы и кредит".
Занимается бизнесом, является совладельцем концерна "Российские огнеупоры".
В 2013 г. занял должность генерального директора компании "ЦентрРегионСтрой".
С 2007 г. является членом Совета Воронежского регионального отделения партии "Справедливая Россия". Два раза становился кандидатом в депутаты Государственной Думы.
Выдвинут кандидатом на пост главы города Воронеж.
Женат, имеет троих детей.
21 августа 2013 года Сергей Худяков снял свою кандидатуру с выборов мэра Воронежа, объяснив свое решение "нежеланием толкаться в толпе желающих прорваться к креслу, не имея уверенности в победе".