Евгений Валентинович Касперский родился 4 октября 1965 года в городе Новороссийск (Краснодарский край).
В 1982 г. окончил физико-математическую школу-интернат № 18 имени А.Н. Колмогорова при Московском государственном университете.
В 1987 г. окончил Высшую краснознаменную школу КГБ СССР (в настоящее время Институт криптографии, связи и информатики Академии ФСБ России).
До 1991 года работал в многопрофильном научно-исследовательском институте Министерства обороны СССР, где в 1989 г. и приступил к изучению феномена компьютерных вирусов.
В 1991-1997 гг. трудился в НТЦ "КАМИ", где вместе с группой единомышленников работал над антивирусным проектом "AVP", который позже получил название "Антивирус Касперского".
В 1997 г. Е. Касперский занялся собственным бизнесом, основав "Лабораторию Касперского". В 2007 г. занял пост ее генерального директора.
На данный момент Е. Касперский входит в число ведущих мировых специалистов в области защиты от вирусов. Его авторству принадлежат сотни статей и обзоров по проблеме компьютерной вирусологии. Регулярно выступает в качестве эксперта на специализированных семинарах и конференциях как в России, так и за рубежом.
Член международной организации исследователей компьютерных вирусов CARО.
В 2010 г. вошел в состав консультативного научного совета фонда "Сколково".
Лауреат Государственной премии РФ в области науки и технологий, а также Национальной премии дружбы КНР.
Награжден медалью "Символ Науки".
Разведен. Есть два сына.
В апреле 2011 г. один из сыновей Е. Касперского был похищен, его выкуп преступники оценили в 3 млн евро. Спустя три дня сотрудники ФСБ и полиции освободили заложника.